Пермская церковь во имя Рождества Пресвятой Богородицы строился в конце XVIII века стараниями купца 2-й гильдии Василия Герасимовича Лапина, но изначально каменный храм возводился в честь Владимирской иконы Божией Матери. Строительство велось на Покровской (ныне Ленина) улице. Переименование в храм Рождества Пресвятой Богородицы и новое освящение произошло 8 сентября 1800 года.
Главный придел в честь Рождества Пресвятой Богородицы был освящён по благословению епископа Пермского и Верхотурского Иустина (Вишневского).
Постепенно церковь расширяли, используя пожертвования горожан. Появились верхний и нижний храмы со своими приделами.
Нижний левый придел (северный) – во имя святителя Николая Чудотворца.
Верхний левый придел – во имя муч.Агриппины.
Нижний правый (южный) придел – во имя вселенских учителей: Василия Великого, Григория Богослова, Иоанна Златоуста.
Верхний правый придел – во имя Воздвижения Креста Господня.
В 1843 году к колокольне пристроили каменную галерею для входа в церковь.
В 1895-96 гг. рядом с церковью на средства прихожан возвели двухэтажную каменную церковно-приходскую школу.
В 1926 году советские власти передали храм обновленцам, но в 1928 году здание церкви отобрали у общины и передали горсовету. В нем разместили учебные классы и общежитие. В этом же году снесли колокольни, а в 1933 году и купола. В дальнейшем здание было передано Пермскому фармацевтическому институту.
С 2009 года Рождество-Богородицкий храм вновь открыл свои двери для прихожан.
